Theo Nghị định số 313/2026/NĐ-CP, Bộ Y tế là cơ quan của Chính phủ, thực hiện chức năng quản lý nhà nước về phòng bệnh; khám bệnh, chữa bệnh, phục hồi chức năng; giám định y khoa, pháp y, pháp y tâm thần; bà mẹ, trẻ em; dân số; phòng, chống tệ nạn xã hội theo phạm vi được giao; bảo trợ xã hội; y, dược cổ truyền; dược, mỹ phẩm; an toàn thực phẩm; thiết bị y tế; bảo hiểm y tế và các dịch vụ công thuộc phạm vi quản lý của Bộ.

Bộ Y tế có trách nhiệm trình Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ các dự án luật, nghị quyết, nghị định; chiến lược, quy hoạch, kế hoạch, chương trình, dự án thuộc phạm vi quản lý nhà nước của Bộ. Đồng thời, Bộ ban hành theo thẩm quyền các thông tư, quyết định, quy chuẩn kỹ thuật, định mức kinh tế - kỹ thuật, quy trình và quy định chuyên môn; hướng dẫn, tổ chức thi hành, kiểm tra và tuyên truyền, phổ biến pháp luật trong các lĩnh vực được giao.

Trong lĩnh vực phòng bệnh, Bộ Y tế quản lý công tác phòng, chống bệnh truyền nhiễm, HIV/AIDS, bệnh không lây nhiễm, bệnh nghề nghiệp, tiêm chủng, kiểm dịch y tế, vệ sinh lao động và các yếu tố nguy cơ ảnh hưởng đến sức khỏe. Bộ tổ chức giám sát, đánh giá nguy cơ, cảnh báo dịch; hướng dẫn, triển khai các biện pháp phòng, chống dịch và ứng phó với các tình huống khẩn cấp về y tế công cộng; chỉ đạo hoạt động chăm sóc sức khỏe ban đầu cho người dân tại cộng đồng.

Đối với lĩnh vực khám bệnh, chữa bệnh và phục hồi chức năng, Bộ Y tế quản lý hoạt động khám bệnh, chữa bệnh, cấp cứu ngoại viện, an toàn truyền máu, điều dưỡng, phục hồi chức năng và kiểm soát nhiễm khuẩn; quản lý việc cấp, gia hạn, điều chỉnh, thu hồi giấy phép hành nghề và giấy phép hoạt động của cơ sở khám bệnh, chữa bệnh theo quy định của pháp luật.

Nghị định quy định Bộ Y tế thực hiện nhiệm vụ quản lý nhà nước về công tác bà mẹ, trẻ em, dân số và bảo trợ xã hội. Trong đó, Bộ xây dựng chính sách, chương trình chăm sóc sức khỏe sinh sản, bảo vệ và thực hiện quyền trẻ em; thực hiện các nhiệm vụ quản lý nhà nước về dân số; xây dựng, hướng dẫn thực hiện chính sách trợ giúp xã hội, trợ cấp hưu trí xã hội, công tác người cao tuổi, người khuyết tật và các đối tượng cần trợ giúp xã hội.

Đối với các lĩnh vực dược, mỹ phẩm, y, dược cổ truyền, thiết bị y tế và an toàn thực phẩm, Bộ Y tế thực hiện xây dựng chính sách, tiêu chuẩn, quy chuẩn; quản lý chất lượng, lưu hành thuốc, nguyên liệu làm thuốc, mỹ phẩm, thiết bị y tế; thực hiện các nội dung quản lý nhà nước về an toàn thực phẩm thuộc thẩm quyền. Bộ đồng thời phối hợp phòng, chống thuốc, mỹ phẩm giả, kém chất lượng và xử lý các nguy cơ, sự cố về an toàn thực phẩm.

Bộ Y tế cũng được giao nhiệm vụ về khoa học, công nghệ, đổi mới sáng tạo và chuyển đổi số trong ngành y tế; xây dựng, quản lý, kết nối và chia sẻ các cơ sở dữ liệu thuộc lĩnh vực y tế, dân số, bảo trợ xã hội; tổ chức ứng dụng công nghệ thông tin, trí tuệ nhân tạo và giao dịch điện tử; bảo đảm an ninh, an toàn hệ thống thông tin y tế.

Về cơ cấu tổ chức, Bộ Y tế có 19 tổ chức, đơn vị, gồm 16 tổ chức giúp Bộ trưởng thực hiện chức năng quản lý nhà nước và 3 đơn vị sự nghiệp công lập phục vụ chức năng quản lý nhà nước là Viện Chiến lược và Chính sách y tế, Trung tâm Thông tin y tế Quốc gia và Báo Sức khỏe và Đời sống.

Nghị định số 313/2026/NĐ-CP có hiệu lực thi hành từ ngày 18/8/2026. Kể từ ngày Nghị định này có hiệu lực, Nghị định số 42/2025/NĐ-CP ngày 27/2/2025 của Chính phủ quy định chức năng, nhiệm vụ, quyền hạn và cơ cấu tổ chức của Bộ Y tế hết hiệu lực thi hành.